Petr Soukenka, analytik Nadačního fondu proti korupci, uvedl, že Šiška měl na ministerstvu klíčovou úlohu, zejména při  zaštiťování veřejných zakázek. Především zakázky na nový informační systém a na systemizaci resortu.

„Pokud vím, tak Šiškovo obvinění se týká zakázky na systemizaci ministerstva,“ uvedl Soukenka. Tuto informaci přitom policie ani ministerstvo prozatím nepotvrdily. Soukenka k zakázce uvedl, že protikorupční fond se jí zabýval, a zjistil v ní znaky nestandardnosti.

„Zakázka byla rozdělená na dvě části,“ popisoval expert. Ta první byla podle něj auditní, vypsána byla jako zakázka malého rozsahu a realizovala ji firma MSM informační systémy. „Pak byla vypsána velká zakázka za 64 milionů. Tu vyhrála společnost Hewlett Packard, ale v konsorciu s MSM informační systémy,“ rozkrýval protikorupčník.