V České republice pokračovala loni příznivá nákazová situace a většina závažných nakažlivých onemocnění se našemu území vyhýbala. Svou zásluhu na tom bezesporu má dobře fungující systém veterinárního dozoru i sami chovatelé a soukromí veterinární lékaři. O dobré nákazové situaci svědčí mezinárodní „statusy země prosté“, které uděluje Evropská komise, nebo Světová organizace pro zdraví zvířat (OIE). V současnosti ČR plní kritéria pro status země prosté vztekliny, tuberkulózy skotu, brucelózy a leukózy skotu, brucelózy ovcí, Aujeszkyho choroby prasat, slintavky a kulhavky a afrického moru koní, moru malých přežvýkavců a status země se zanedbatelným rizikem BSE.  V loňském roce byl ČR nově udělen status země prosté klasického moru prasat. Statusy jsou velmi důležité pro vývozce zvířat i živočišných produktů, protože napomáhají s otvíráním trhů ve třetích zemích.

Loni v ČR pokračovaly programy pro tlumení a eradikaci některých nákaz. Ke konci roku 2016 byl ukončen Národní ozdravovací program od infekční bovinní rinotracheitidy skotu (IBR), který běžel 10 let.  Výsledky se v současné době vyhodnocují, ale lze očekávat, že přes 99 procent hospodářství bude úředně prostých IBR. Ve zbylých hospodářství letos ozdravování pokračuje. Do konce února bude připravena žádost o přiznání statusu země prosté této nákazy, která bude následně zaslaná Evropské komisi. S cílem zajistit zdravotní nezávadnost drůbežího masa a konzumních vajec pokračovaly v roce 2016 v chovech drůbeže Národní programy pro tlumení výskytu salmonel. Dobrou zprávou je především pokles výskytu salmonel ve výkrmu brojlerů.

Mezi dlouhodobé priority SVS patří také zlepšování životní pohody zvířat (welfare) i obecného povědomí o této problematice v ČR. Úřední veterinární lékaři SVS každoročně uskuteční tisíce kontrol chovů. V roce 2016 bylo v chovech hospodářských zvířat provedeno celkem 2 200 kontrol, z toho 346 kontrol bylo se závadou. V chovech zájmových zvířat bylo provedeno celkem 2 394 kontrol, z toho u 576 z nich byla zjištěna nějaká závada. Nejčastějšími nedostatky byly nevhodné podmínky chovu, omezování výživy a napájení, nezabezpečení zvířete proti úniku, opuštění zvířete či nevhodné způsoby uvazování.