Pro Českou republiku zpráva nepředstavuje lichotivé vysvědčení: celých 95 % občanů ČR souhlasí s tvrzením, že korupce je v jejich zemi rozšířená, což je oproti 76 % průměru EU alarmující. Ještě horší je veřejná image podniků - více než 71 % českých respondentů uvedlo, že hlavní překážkou pro podnikání je korupce (jde o nejvyšší procentní podíl v EU). Komise upozorňuje především na problémy spojené se zadáváním veřejných zakázek (80 % zakázek zadávaných ministerstvy v letech 2006 až 2010 zadáno neveřejně či bez soutěže) a zneužívání veřejných finančních.