Zeštíhlení a zjednodušení struktury Ministerstva pro místní rozvoj je téměř dokončeno. Hlavní změny se dotkly zejména funkcí náměstků a vrchních ředitelů sekcí. Zjednodušila se také struktura úřadu a snížil počet zaměstnanců. Doposud bylo uvolněno 42 systematizovaných míst. Veškeré změny probíhají na základě výsledků proběhlého personálního a procesního auditu.

Ve vedení ministerstva jsou aktuálně čtyři náměstci. Funkci 1. náměstka ministra zastává Daniel Braun. Ten řídí Národní orgán koordinace (NOK), který se věnuje problematice strukturálních fondů a evropských záležitostí. Náměstkem ministra pro regionální rozvoj a cestovní ruch je Michal Janeba. Za bytovou a stavební problematiku bude dále zodpovědný náměstek Miroslav Kalous.

Novým náměstkem ministra pro řízení úřadu a legislativu je Michal Koláček. Do jeho kompetence spadá řízení Sekce rozpočtu, Sekce legislativně právní a ostatních odborů spojených s chodem úřadu.