Celkem tedy bude eSeL vznikat devět let. Ministerstvo zároveň téměř zdvojnásobilo plánované výdaje, které byly původně stanoveny na 482 mil. Kč. Systém se měl skládat ze dvou částí: elektronické „Sbírky zákonů a mezinárodních smluv“ (e-Sbírka) a elektronické tvorby právních předpisů (e-Legislativa); proto zkratka eSeL. V současnosti je však funkční jen e-Sbírka. Kontroloři prověřili 725 mil. Kč, které MV vynaložilo na realizaci systému do 30. června 2024. 

Systém eSeL měl vzniknout především díky spolufinancování z prostředků evropských fondů. Ty měly krýt 81 % celkových výdajů. Zbývající část měla být hrazena ze státního rozpočtu. „Při řízení projektu eSeL Ministerstvo vnitra selhalo. Jeho realizaci prodloužilo o šest let a rozpočet projektu téměř zdvojnásobilo na 903 mil. Kč. Podíl zapojení evropských fondů se po změnách projektu snížil na 42 %, zatímco podíl státního rozpočtu se zvýšil z původně plánovaných 19 % na 58 %. Veškeré dodatečné výdaje, které se nakumulovaly opakovanými žádostmi o změnu, jsou totiž hrazeny ze státního rozpočtu,“ shrnul výsledky kontroly člen NKÚ Stanislav Koucký, který ji vedl. 

Do prosince 2024 podalo MV celkem 22 žádostí o změnu projektu, kterými mj. opakovaně žádalo o prodloužení termínu dokončení a o navýšení rozpočtu. Ministerstvo pro místní rozvoj, coby řídicí orgán prostředků z evropských fondů, všechny tyto žádosti schválilo.