Nově je nutné v případě obchodu z ČR do jiného státu EU a v případě dovozu do ČR ze třetí země provést na území ČR karanténu mloků. Toto zařízení musí být nejprve registrováno a poté dozorováno příslušnou krajskou veterinární správou. Každá zásilka mloků musí být mj. doprovázena také veterinárním osvědčením, které odpovídá vzoru stanovenému v rozhodnutí. Během karantény mloků má provozovatel nebo dovozce povinnost zajistit na své náklady požadované vyšetření, odběr vzorků a příslušná testování nebo ošetření mloků. Karanténa mloků musí splňovat požadavky – např. čistitelné a dezinfikovatelné prostory, příslušné nakládání s odpadem a odpadními vodami, testy a ošetření mloků, vedení evidence a další.

Do 6. září 2018 platí pro obchod s mloky uvnitř EU přechodné období. Před odesláním zásilky mloků do jiného členského státu je do zářijového termínu obchodník povinen ověřit si veterinární podmínky u kompetentní veterinární autority dané země. Některé země mohou vyžadovat karanténu a úředně potvrzené doklady k zásilce už během přechodného období, jiné ne. V případě, že členský stát nebude do té doby vyžadovat plnění požadavků nového rozhodnutí, platí současné podmínky. Tuto stávající variantu bude uplatňovat pro zásilky mloků z jiných členských zemí také Česká republika.