Nejvyšší kontolní úřad se zaměřil na období let 2012 až 2014. Upozornil například na to, že na co má úřad své lidi, nemůže nechat vytvářet externisty na mimopracovní dohody. A právě mnohé dohody nedokáže úřad ani rozklíčovat. Týká se to například Lukáše Kauckého, který byl v roce 2013 poradcem. Kontrolní protokol nyní uvádí, že ve výkazech práce nejsou poradenské činnosti konkretizovány. „Je uvedeno jen zpracování vládní agendy, příprava vládní agendy, nebo není uvedeno nic,“ stojí v kontrolním protokolu. A není jedinou osobou, u které není jasno. Ministerstvo se však kontrole brání. Podle něj vykonanou práci potvrzuje měsíční výkaz odpracovaných hodin.