Za další problém zpráva označila personální nestabilitu nově budovaného útvaru. Policie kritiku z větší části již dříve odmítla. Informace o fungování nového útvaru, od jehož vzniku 1. srpna uplyne jeden rok, chce poskytnout v nejbližších dnech. Vedení policie však loňskou reorganizaci dlouhodobě hájí.

Loňskému vzniku centrály předcházela vážná vládní krize mezi sociální demokracií a hnutím ANO, které bylo proti sloučení útvarů. Ke kritice se přidal také bývalý ředitel protimafiánského útvaru Robert Šlachta, který se stal jedním z hlavních aktérů bouřlivého dění, když chtěl předat poslancům informace o údajných podezřelých okolnostech reorganizace. Kvůli zániku útvaru, který vedl, se rozhodl od policie odejít.

"Naprosto si stojím za svým rozhodnutím a myslím si, že bych to udělal znovu," řekl Šlachta. Podle něj bylo sloučení útvarů uspěchané a nemělo se stát. "Byl to nesmysl," dodal Šlachta. Od policie zamířil na pozici náměstka šéfa celníků v době, kdy ministerstvo financí řídil šéf hnutí ANO Andrej Babiš, který byl hlavním odpůrcem reformy na politické scéně.

Mezi další hlasité kritiky patřili státní zástupci, kteří se obávali zejména odchodů zkušených policistů, možného zastavení vyšetřování některých kauz nebo horší efektivnosti řízení velkého útvaru. Ve výroční zprávě, která se týká prvních pěti měsíců fungování nového útvaru, státní zástupci pochválili spolupráci s regionálními pobočkami centrály a některými sekcemi, některé policisty ale zkritizovali.

Sloučení mělo negativní vliv