Propouštění vězňů na svobodu mohou brzdit technické možnosti jednotlivých věznic. Po rozhodnutí soudu o propuštění totiž musí každý vězeň absolvovat zdravotní a výstupní prohlídku a další formality, které zaberou zhruba dvě hodiny. Věznice tak mohou podle generálního ředitele vězeňské služby Petra Dohnala propustit řádově desítky vězněných osob denně.

Někteří soudci studují spisy desítek vězňů na soudech. Řada trestních soudců se ale vypravila společně s administrativními pracovnicemi a státními zástupci přímo do věznic. Některé soudy musely kvůli projednávání případů amnestie zrušit dříve nařízená jednání.

Podle předsedy pražského městského soudu Jana Sváčka, který je členem koordinační skupiny ministerstva spravedlnosti, se soudci snaží dělat vše pro to, aby ještě během dnešního dne vydali rozhodnutí o propuštění všech dotčených vězňů. Teprve později se budou zabývat případy odsouzených k podmíněným či alternativním trestům, na něž se amnestie rovněž vztahuje. Neveřejná zasedání, ve kterých soudci rozhodují, se mohou protáhnout o několik dnů až týdnů v případě, že proti verdiktu soudu podá vězeň či státní zástupce stížnost.