Jedním z úředníků, který rozděloval svého času evropské dotace ve středních Čechách, byl Marek Kupsa. Ten právě přiklepl dvě stě milionů korun na rozvoj cestovního ruchu. A část přišla i do Farmy Čapí Hnízdo na výstavbu stejnojmenného kongresového centra. Dotací se nyní zabývá nejen česká policie, ale také Evropský úřad pro boj proti podvodům. Prověřuje se, zda farma měla na dotaci nárok, nebo zda oklamala úřad či zákon porušili sami úředníci. Kupsa od roku 2014 pracuje na ministerstvu pro místní rozvoj, stejně jako Jiří Kořínek, který byl v době rozhodování o dotaci na Čapí hnízdo Kupsovým podřízeným. 

Policie celou kauzu prošetřuje na základě anonymního trestního oznámení, v němž je uvedeno, že firma neměla finance získat kvůli tomu, že nebyla malou či střední firmou. Firma, která dotaci získala, původně spadala pod Agrofert, ale v době, kdy o peníze požádala, již nebylo možné majitele zjistit. Podle Babiše je tato kauza politickou objednávkou.