Personál chrámu byl zpočátku zcela šokovaný a chrámové stráži se podařilo vytlačit mladé ženy ven až po několika minutách. Policie však proti nim nijak nezasáhla a nějaký čas bylo kolem případu ticho.

Po dvou týdnech však byly tři zmíněné členky kapely zatčeny a umístěny do vyšetřovací vazby. Z té se už se pak nedostaly. I v této chvíli mnozí doufali, že dívky dostanou trest v podobě peněžní pokuty či veřejně prospěšných prací. K nelíčenému překvapení všech však vyšetřování a poté soud jednání Pussy Riot nekvalifikovaly jako drobnou výtržnost, ale jako vyvolávání náboženské nesnášenlivosti a urážení náboženského cítění jiných spoluobčanů, za což by mohly dostat až sedm let. 

Zajímavé bylo, že za stranu žalující, která přivedla do soudní síně sedm svědků, vystoupili kromě věřících a zaměstnanců chrámu celé akci přímo přítomných i lidé, kteří v chrámu během performance vůbec nebyli a jen viděli videoklip. Ti všichni však svorně tvrdí, že bylo dotčeno jejich náboženské cítění, že byli svědky rouhání a svatokrádeže a že mladé punkerky opakovaně vykřikovaly neslušná a vulgární slova. Samy obviněné po celou dobu procesu něco takového odmítaly a své jednání vysvětlují jako výhradně politický protest proti prorůstání Putinova státu a ruské pravoslavné církve.