Současně se plánují nové železniční zastávky v Jihlavě a nová spojení na území města. Centrální dopravní terminál (CDT) se stane hlavní vstupní branou do Jihlavy. Na právě přestavované městské vlakové nádraží, ze kterého CDT vznikne, by měly jezdit i vlaky od Třebíče. Projektanti právě prověřují několik tunelových variant z Malého Beranova, každou z nich se zastávkou u Dřevěných Mlýnů a jednu také se zastávkou u sídliště Březinova.

Na CDT se nyní staví nová nástupiště a k nim s příchodem VRT do Jihlavy přibydou ještě další dvě ostrovní nástupiště a druhý podchod. Na vedlejším autobusovém nádraží a terminálu MHD budou moci cestující přestoupit do blízkých i vzdálenějších cílů, což vytvoří moderní uzel hromadné dopravy. Současné hlavní nádraží na konci Havlíčkovy ulice poslouží nákladní dopravě a jako zázemí.

Nová železniční spojení ve městě