V pomoci v ochraně přírody v Zakavkazsku se AOPK ČR angažuje více než deset let. Jde totiž o území s vysokou biodiverzitou a vysokou mírou endemismu, stovky druhů, které zde žijí, se nevyskytují nikde jinde na světě. Jenom v Arménii je 479 druhů bezobratlých, 16 druhů obratlovců a 142 druhů vyšších rostlin považováno za endemické. 

S arménským ministerstvem životního prostředí začala AOPK ČR úzce spolupracovat v roce 2021, kdy se podařilo získat evropský grant z programu Twinning. Společně s finským environmentálním institutem SYKE navrhla úpravy k zefektivnění legislativy v souladu s evropskými směrnicemi na ochranu biotopů a druhů. Arménie se totiž zavázala v rámci tzv. Východního partnerství a dohody CEPA s Evropskou unií aplikovat evropskou legislativu na ochranu své přírody.