Záměr přebudovat původně účelové sanatorium pro vysoké komunistické funkcionáře na zařízení, které by poskytovalo specializovanou péči všem pacientům, vzešel velmi záhy po roce 1989 z jednání tehdejšího ministerstva zdravotnictví a odborné pracovní skupiny Občanského fóra. Byla zde akutní potřeba rozšířit kapacity pro léčbu nemocí nervové soustavy a nemocí srdce a cév. Právní subjektivitu nemocnice získala 25. listopadu 1990 a během velmi krátké doby si vybudovala renomé technicky vyspělého a personálně skvěle zajištěného pracoviště. Počet ošetřených pacientů se neustále zvyšoval a s nimi rostl i počet operačních sálů, intenzivních lůžek a lůžek pooperační péče. Za 30 let existence byla v Nemocnici Na Homolce provedena řada unikátních operačních a léčebných výkonů, které posunuly léčbu pacientů výrazně vpřed a dosáhly světového uznání.

„Výjimečnost Nemocnice Na Homolce spočívá především v zajištění komplexní specializované péče o pacienty s neurologicko-neurochirurgickými onemocněními, kardiovaskulárními onemocněními a v rozsáhlém diagnostickém programu. Nejdůležitější krok v historii Homolky nastal v roce 1990, kdy bylo rozhodnuto, že se původně elitářské zařízení otevře všem občanům a u toho by vždy mělo zůstat,“ říká ředitel nemocnice MUDr. Petr Polouček, MBA, který je v čele nemocnice od roku 2018.