Monitoring je mimo zasaženou lokalitu preventivně zaměřen i na tok Bečva v úseku Hustopeče nad Bečvou po ústí do Moravy. Oproti běžnému monitoringu jsou vzorky odebírány se zvýšenou četností a současně byl rozšířen počet odběrných míst. V současné době probíhá sledování na řece Bečvě na 5 odběrných místech. Současně akreditovaná vodohospodářská laboratoř Povodí Moravy bezodkladně, okamžitě po doručení vzorků, provádí analýzy vzorků, které jsou každodenně odebírány v přímém okolí havárie. Tento monitoring je koordinován a zjišťován Českou inspekcí životního prostředí. Vzhledem ke skutečnosti, že se jedná o vysoce odborné, technicky i časově náročné analýzy a potřebě co nejaktuálnějších výsledků, příprava vzorků a měření probíhají nepřetržitě 24 hodin denně. ČIŽP na základě zjištěného stavu koordinuje provádění sanačních prací v místě havárie. Nad rámec těchto analýz je sledováno ze strany Povodí Moravy, s.p. i oživení Bečvy vodními společenstvy.