Dále je v provozu aerační systém na hlavním jezeře, který pomáhá okysličovat vodu u dna a promíchává celý vodní sloupec, kdy okysličenou vodu z vrchních vrstev posunuje směrem ke dnu a tím ztěžuje životní cyklus sinic. Cílem celého projektu je udržet pokud možno rovnovážný stav povrchových vod v údolní nádrži Brno.

Tato opatření významně pomáhají s omezováním rozvoje toxických sinic ve vodní nádrži. Nicméně letošní brzký extrémní nástup velmi teplého počasí již v měsíci dubnu a s tím doprovázené sucho, které v povodí řeky Svratky stále panuje, podpořily nástup rozvoje fytoplanktonu v daleko dřívějším období než v předcházejících letech a etapách projektu. Extrémní sucho a velmi vysoké teploty, které nelze ovlivnit žádným dalším opatřením v nádrži či povodí, tento nepříznivý stav mohou dále prohlubovat. „Prakticky od počátku jara máme v důsledku sucha velmi nízké průtoky v řekách, což způsobuje výrazné zhoršení kvality vody, neboť odpadní vody není možné dostatečně naředit. Zdržení vody v nádrži přehrady se vlivem nízkých průtoků v současné době prodlužuje z obvyklých 20 až 30 dnů na hodnotu až 75 dnů, což vůbec nepřispívá k udržení rovnovážného stavu povrchových vod,“ vysvětluje generální ředitel Povodí Moravy, s. p. Václav Gargulák.