Původně vedení magistrátu naplánovalo rozsáhlou rekonstrukci Karlova mostu do tří na sebe navazujících etap. Tu první si vynutila velká voda roku 2002, která poničila dva pilíře mostu, trvala tři roky a po ní následovala druhá etapa, jenž zahrnovala opravu mostovky a zábradlí.

Druhá fáze byla hojně kritizována

Tato druhá fáze trvala už přes dva roky a práci kritizovala památková inspekce ministerstva kultury. Podle ní bylo nahrazeno více kamenných bloků, než doporučil průzkum. Pochybení při opravě konstatoval i Národní památkový ústav. Kvůli opravě mostu také podala Asociace sdružení pro ochranu a rozvoj kulturního dědictví trestní oznámení na neznámého pachatele a Praha dostala pokutu 3,25 milionu korun