Předložená dokumentace byla nedostatečná, chyběla tzv. nulová varianta (náhrada výkonu nových jaderných bloků kombinací jiných zdrojů), nebyly vyhodnoceny vlivy souvisejících staveb a činností (např. likvidace jaderné elektrárny, likvidace vyhořelého jaderného paliva). Posuzována byla „virtuální“ elektrárna, nikoli elektrárna s konkrétními reaktory, ač požadavek MŽP pod vedením ministra Martina Bursíka zněl: „ ...uvést konkrétní technický a technologický popis všech typů reaktorů.“ Ignorována byla ale i celá řada dalších podmínek ministerstva.

Souhlas ministerstva životního prostředí navíc neznamená, že nové reaktory v Temelíně budou postaveny, protože z ekonomického hlediska jde o vysoce rizikovou investici. Z toho důvodu ministr průmyslu Martin Kuba ruku v ruce s ČEZ připravují zavést garantovanou cenu elektřiny pro atomové elektrárny, která může citelně zdražit elektřinu v Česku.

„Dokumentace k záměru výstavby nových jaderných bloků předložená v procesu posuzování vlivů na životní prostředí vykazovala vážné nedostatky. Ministerstvo životního prostředí ji přesto akceptovalo a vydalo souhlasné stanovisko. Je to odborné selhání ministerských úředníků a politický faul ministra Chalupy,“ říká Ondřej Liška, předseda SZ.