Piráti se postavili proti hlavním návrhům, jako je Řízení migrace a azylu, reakce na krizové a nepředvídatelné situace, systém Eurodac či nařízení o prověření. „Migrační balíček jsme brali jako možnost konečně adresovat zásadní problémy, se kterými se Evropa ve snaze zvládat migraci potýká. Výsledný dokument nás však nepřesvědčil. Nemůžeme balíček v aktuální podobě podpořit, protože nevěříme, že může přinést zásadnější změny pro viditelné problémy, zato si všímáme, že snižuje humanistické standardy. To první je pro nás samo o sobě důvodem k odmítnutí, to druhé je pro nás nepřijatelné,” vysvětluje europoslankyně Markéta Gregorová.

Jedním z problémů paktu podle Pirátů je chabá revize Dublinského systému. Pakt podle nich důsledku zhoršuje princip prvního vstupu a pokračuje v prohlubování neúnosného náporu na státy prvního vstupu.