Studie prokázala, že záměr je investorsky a ekonomicky nevýhodný ve všech variantách. Podle poslance KDU-ČSL a bývalého ministra zemědělství Mariana Jurečky může navíc výstavba ohrozit okolní zdroje pitné vody, voda z průplavu se totiž dostane do kontaktu s podzemními i povrchovými vodami.

„Kanál urychlí šíření invazivních druhů a patogenů. Průplav také zasáhne do vysokého počtu vodohospodářsky významných vodních útvarů, prochází přes infiltrační oblasti zdrojů pitných vod. V praxi to znamená, že může dojít ke znečištění pitné vody,“ jmenuje rizika stavby Marian Jurečka, kterého udivuje i fakt, že kanál podle studie nepočítá s dnes realizovanými a plánovanými protipovodňovými opatřeními. V případě povodní by se tak voda odváděla kanálem, což ale odborníci nedoporučují.

Zásadní slabinou celého záměru jsou podle něj také úzká a neprůchodná místa na zahraničních úsecích na Labi, Dunaji i Odře. Pokud nedojde k odstranění těchto těžko dostupných míst, není možné části řek adekvátně využívat k dopravě. „Navíc v projektu chybí zcela zásadní posudek, který by zhodnotil vliv výstavby na půdu. Celkově se jí zabere asi 50 kilometrů čtverečních," upozorňuje.