Smlouva totiž obsahuje kontroverzní ustanovení o zpovědním tajemství, které možnost nevypovídat rozšiřuje i na blíže nedefinované tzv. pastorační pracovníky. Piráti dlouhodobě upozorňují, že tato smlouva může mít negativní dopady na vyšetřování trestných činů, především v případech sexuálního zneužívání v církevním prostředí.

„To, že Senát nakonec schválil smlouvu s Vatikánem i bez předchozího přezkumu souladu s ústavním pořádkem Ústavním soudem, mě, musím říct, zklamalo. Vnímám to jako další krok zpět v ochraně práv obětí v církevním prostředí. Pochybnosti o tom, na jaké případy se zpovědní tajemství vztahuje a zda jej mohou uplatnit i další pastorační pracovníci, aniž bychom přesně věděli, o jaké konkrétní pracovníky se jedná, mně nenechávají v klidu. To celé totiž v konečném důsledku může vést k dalšímu zamlčování závažných trestných činů. A to je něco, s čím se já, ač věřící, která vždy bude obhajovat svobodu vyznání, nechci smířit. V církvi a církevních institucích pracujících s mládeží je bohužel až příliš mnoho případů, kdy se oběti díky uzavřenosti těchto institucí nemají na koho obrátit. To by mělo skončit a církev by se tomu měla konečně již postavit čelem,“ uvedla senátorka Adéla Šípová.

Piráti také poukazují na skutečnost, že zpovědní tajemství – klíčová podmínka smlouvy – otevírá prostor pro zneužití církevních privilegií k utajování trestné činnosti. Proto navrhují, aby nezávislí právní experti posoudili dopady smlouvy na oběti sexuálního zneužívání.