Vzhledem k obtížné předvídatelnosti celkových dopadů je rozpočet Zlínského kraje na rok 2021 navržen konzervativně tak, abychom pokryli nejdůležitější provozní potřeby jak krajského úřadu, tak krajských organizací. Současně díky zasmluvněnému úvěru je zajištěn zdroj finančních prostředků pro předfinancování a spolufinancování evropských projektů. Další požadavky na rozpočet budou realizovány i v průběhu roku 2021, podle urgentnosti a finančních možností kraje.

Celkové příjmy jsou tvořeny vlastními příjmy ve výši 4 miliardy 349 milionů 126 tisíc korun, což představuje 29,13 %, a přijatými transfery (dotacemi) ve výši 10 miliard 580 milionů 986 tisíc korun, tj. 70,87 %. Ve srovnání s rokem 2020 dochází ke snížení vlastních příjmů, a naopak se zvyšuje podíl přijatých transferů. Pokles vlastních příjmů je očekáván zejména u sdílených daní (o 332 milionů korun), a to v návaznosti na vládní opatření související s pandemií covid-19. 

Z celkových výdajů tvoří běžné výdaje 13 miliard 935 milionů 910 tisíc korun (89,53 %) a kapitálové (investiční) výdaje 1 miliardu 630 milionů 202 tisíc korun (10,47 %). Nejvýznamnějšími položkami běžných výdajů jsou transfery ze státního rozpočtu určené na přímé vzdělávání (8 miliard 660 milionů korun) v důsledku pokračujícího trendu růstu platů zaměstnanců ve školství a transfery pro poskytovatele sociálních služeb (1 miliarda 244 milionů 137 tisíc korun). Vlastními zdroji zajišťuje Zlínský kraj zejména příspěvek na provoz svým příspěvkovým organizacím v oblasti dopravy, zdravotnictví, školství, kultury a sociálních věcí ve výši 1 miliardy 254 milionů 92 tisíc korun, či financování dopravní obslužnosti Zlínského kraje (1 miliarda 427 milionů 858 tisíc korun). Kapitálové výdaje budou směřovány jednak na investiční akce a pořízení nového majetku, ale také na rekonstrukce stávajících zařízení v oblasti školství, sociálních věcí či zdravotnictví. Pro Fond Zlínského kraje bude vyčleněno 859 milionů korun. Vázány budou především na realizaci projektů spolufinancovaných EU (např. Podpora a rozvoj služeb sociální rehabilitace ve Zlínském kraji, Revitalizace národních kulturních památek Velké Moravy, Zachování a rozvoj areálu na Ploštině, Revitalizace hospodářského dvora v Rymicích) a dále také na podporu dotačních programů vyhlašovaných krajem i na individuální podporu.