Finanční správa vyvíjí veškeré úsilí, aby odložení plnění daňových povinností a s tím související prominutí sankcí bylo maximálně automatizované. Nicméně v praxi nelze vyloučit, že v některých případech nebude mít v přiměřené lhůtě k dispozici identifikace dotčených daňových subjektů (např. z důvodu pozdějšího zaslání oznámení apod.) a tedy dotčenému subjektu může být zaslána výzva ke splnění povinností nebo vyměřena sankce na skutečnosti, které jsou předmětem generálního pardonu.