Smlouva představuje rámec pro spolupráci MZ ČR a Regionální úřadovny WHO pro Evropu, který definuje prioritní oblasti této spolupráce, její očekávané výsledky, finanční rámec i charakter. Základní prioritou tohoto dokumentu je implementace vize zdravotní strategie Evropského regionu WHO Zdraví 2020 v ČR ve čtyřech hlavních programových prioritních oblastech spolupráce, které jsou ve smlouvě vymezeny. Jedná se o přenosná onemocnění, nepřenosná onemocnění, podporu zdraví během života a zdravotnické systémy.

ČR sjednává Dvouletou smlouvu o spolupráci od roku 1998. Na roky 2018–2019 alokovala WHO cca 3 000 000 Kč (cca 150 000 USD). Příjemcem finančních prostředků není MZ, nýbrž řešitelé jednotlivých aktivit (např. SZÚ, odborné společnosti ČLS JEP aj.). Aktivity i řešitelé jsou vybíráni ve spolupráci odborných útvarů MZ a Národní kanceláře WHO.