Díky tomu, že kontrola začala již v průběhu účetního období roku 2022, mohlo MŽP průběžně opravovat významné nedostatky, které kontroloři zjistili a které by měly ve výši 40,2 mld. Kč vliv na zůstatky položek účetní závěrky MŽP za rok 2022.

K nejvýznamnějším opravám patří doúčtování podílu ČR na finančních aktivech „Modernizačního fondu“ ve výši 24,5 mld. Kč spravovaných Evropskou investiční bankou. MŽP tak vykazuje ve své účetní závěrce aktiva, která mají formu dostupných finančních prostředků ČR.

Po provedených opravách bylo účetnictví MŽP podle názoru NKÚ vedeno v souladu s právními předpisy. Nesprávnosti ve výši 4,6 milionu korun, které MŽP neopravilo, neměly významný dopad na účetní závěrku, která dle NKÚ podává věrný a poctivý obraz předmětu účetnictví.

Závěrečný účet MŽP ani údaje, které MŽP předložilo pro hodnocení plnění státního rozpočtu za rok 2022, neobsahovaly významné nesprávnosti; tyto údaje jsou proto dle NKÚ spolehlivé.

Vnitřní kontrolní systém MŽP byl po opatřeních přijatých v průběhu kontroly v prověřovaných oblastech vyhodnocen ze strany NKÚ jako účinný.