V žebříčku Rady pro výzkum, vývoj a inovace Úřadu vlády České republiky se Národní muzeum z 220 posuzovaných výzkumných institucí umístilo na 56. místě. Jedná se o nejlepší umístění potvrzující vůdčí roli Národního muzea v oblasti vědy a výzkumu ve srovnání s ostatními paměťovými a sbírkotvornými institucemi v rámci rezortu Ministerstva kultury České republiky. Tímto výsledkem se NM také zařadilo před celou řadu výhradně vědecky zaměřených organizací.

Národní muzeum v roli výzkumné organizace uskutečňuje širokou škálu aktivit v rámci základního a aplikovaného výzkumu v oblasti přírodních i humanitních věd. Výsledky své práce prezentuje prostřednictvím článků v prestižních vědeckých časopisech, vědeckých publikací, výstupů na konferencích i prostřednictvím popularizačních a vzdělávacích aktivit. Právě publikační aktivita byla hlavním kritériem zveřejněného hodnocení výzkumných organizací. Úspěch se opírá o excelentní výstupy například v oblasti mineralogie, entomologie, zoologie, paleontologie, archeologie, antropologie či etnologie.

Jen pro zajímavost, v letech 2010–2014 zaměstnanci Národního muzea kromě sbírkotvorné, výstavní a popularizační aktivity publikovali přes 300 článků v impaktovaných časopisech, pracovali na 117 projektech a přednesli 835 příspěvků na konferencích.

Národní muzeum tímto pokračuje v téměř dvě staletí trvající tradici, která sahá k zakladatelským osobnostem české vědy.