Nejvýznamnější nesprávnost v účetní závěrce představuje nesprávné vykázání přijatých refundací spolufinancovaných transferů v hodnotě 1,1 miliardy korun. Ministerstvo také v přehledu o změnách vlastního kapitálu nesprávně vykázalo 227 milionů korun týkajících se snížení závazku v rámci finančního vyrovnání s církvemi. Kontrola také ověřila, že resort ve svém účetnictví vykazuje závazek vůči církvím ve výši téměř 57 miliard korun. Ten odpovídá zákonem stanovené výši.

Ke spolehlivosti údajů účetní závěrky jako celku se ale NKÚ nevyjádřil. Důvodem byly nejednoznačnosti v účetních předpisech týkající se zejména předfinancování transferů spolufinancovaných z EU, které tvořily významnou část účetní závěrky Ministerstva kultury. Tento problém byl vyřešen novelou předpisů pro účetnictví účinnou od začátku roku 2015.