Hlavními oblastmi spolupráce jsou sdílení vzdělávacích programů, informací a materiálů, příprava výstav, expozic a dalších aktivit o přínosech biodiverzity. V neposlední řadě také spolupráce v oblasti vědy a výzkumu.

Obě instituce se shodují zejména na důležitosti environmentálního vzdělávání a osvěty. „Spolupráce s Národním zemědělským muzeem nám otevírá nové možnosti, jak veřejnosti přiblížit ochranu přírody a krajiny, mimo jiné v kontextu zemědělství a hospodaření s přírodními zdroji,“ uvedl František Pelc, ředitel AOPK ČR.