Úřad a následně předseda Úřadu Petr Rafaj v roce 2016 a 2017 ve svých rozhodnutích konstatovali, že hlavní město Praha porušilo zákon o veřejných zakázkách, když bez použití některého ze zadávacích řízení upravených zákonem rozšířilo zakázku na výstavbu souboru staveb městského okruhu o stavební práce spočívající v realizaci nového Trojského mostu odchylujícího se od jeho původně navrhované podoby. Za nezákonné jednání uložil Úřad zadavateli pokutu ve výši 11 milionů korun.