Neznámější kauza Michala Krause se datuje do roku 2001, kdy společně s podnikatelem Františkem Rigem zakoupil podnik na zpracování kakaových bobů v africké Ghaně. Rigo byl později odsouzen za podvody, Krause aféra stála poslanecké křeslo, neboť nebyl schopen vysvětlit, kde sehnal dva miliony na zálohu za továrnu.

Nečisté peníze se zřejmě praly i v kauze Harrachov. Kraus, tehdy předseda rozpočtového výboru poslanecké sněmovny, přiklepl se svými podřízenými dotaci na neziskové sportovní centrum v Harrachově. Pověřená firma však místo něho postavila luxusní hotel.

Přesto Kraus dlouhá léta působil na vedoucích pozicích liberecké ČSSD. Při posledních volbách však žádnou pozici neobhájil.