Ioannidis se v letošním roce věnoval studii zaměřené na určení míry úmrtnosti způsobené novým koronavirem covid-19. Pro server LekarskeNoviny.sk se k ní vyjádřil, stejně jako ke sporu s Igorem Matovičem, premiérem Slovenska. Matovič totiž jeho studii označil za hoax a zaútočil na slovenské lékaře, kteří se na ni odvolávali. Rozčílilo jej totiž Ioannidisovo srovnání závažnosti onemocnění - chřipky a covidu-19. 

"Nechápu, jak je možné moji studii nazvat hoaxem. Je to recenzovaný článek v oficiálním vědeckém časopise Světové zdravotnické organizace," uvedl Ioannidis s tím, že jde o výsledky založené na 82 měřeních z celého světa. "Medián míry smrtnosti je o mnoho nižší, než jsme si mysleli v prvních dnech pandemie. Je velmi závislý od věkové struktury a od toho, zda jsou zasažené domy s pečovatelskou službou. Pro lidi, kterým je méně než 70 let, je medián míry smrtnosti nižší než 0,05 procenta. Myslím si, že je chybou, že se toto téma stává předmětem politického boje," míní Ioannidis.