Podle informací serveru iROZHLAS.cz tvoří v současné době účet za Unií nekryté dotace zhruba 163 milionů korun. Žádanky o proplacení zadržuje Ministerstvo financí. Začalo to v roce 2018, když se v Bruselu chystala auditní mise prověřující možný střet zájmů premiéra Andreje Babiše (ANO) a dotace pro firmy z Agrofertu. Ministerstvo financí tehdy preventivně přestalo žádat Evropskou komisi o jejich proplacení.

A v některých případech je už ani neproplatí – například v případě dotace na toustový chléb Penam. Ministerstvo průmyslu a obchodu nyní navíc zahájilo novou prověrku, kterou potvrdilo i Ministerstvo financí. Důvodem je velký počet chyb v daném operačním programu Podnikání a inovace pro konkurenceschopnost. 

V plošné prověrce je nyní celkem dvanáct projektů, na seznamu dotací, které Ministerstvo financí nepředložilo Evropské komisi k proplacení, jich figuruje patnáct.