Průzkumná verze L-29 R, vyvinutá pod krycím názvem „Oko“, byla odvozena z cvičného letounu L-29 a přinesla významná vylepšení. „Speciální kontejner obsahující fotografická zařízení byl umístěný pod pilotní kabinou na spodní straně trupu,“ uvedla Radka Černá, tisková mluvčí společnosti Aero Vodochody. Letoun byl vybaven leteckými fotoaparáty pro šikmé a svislé snímkování terénu, a díky přídavným palivovým nádržím instalovaným na koncích křídel byl jeho dolet prodloužen, což z něj činilo ideální stroj pro průzkumné mise.

Mezi lety 1963 a 1974 bylo vyrobeno celkem 3 665 kusů letounu L-29 ve všech variantách. Kromě průzkumné verze L-29 R vznikly i další speciální verze, jako například akrobatická varianta L-29 A a jednomístná verze pro pokročilý výcvik L-29 RS.