Grégr byl krátce ministrem hned po roce 1990. V roce 1998 se vrátil ve vládě Miloše Zemana a zdědil, jak vzpomíná, „dračí vejce“ v podobě rozestavěné elektrárny Temelín. Když nastupoval na ministerstvo, byla stavba již za polovinou, ale stále se diskutovalo o tom, zda ji dostavět, nebo nikoliv.

Ministr životního prostředí Miloš Kužvart, který stavbu nepodporoval, si prý nechal udělat průzkum veřejného mínění. Jenže ten vyšel tak, že 70 procent obyvatel je pro dostavbu, což všechny překvapilo. Navíc prý svůj názor dlouho nevyjádřil premiér Zeman, takže před klíčovým hlasováním vlády panovala nejistota. Nakonec vláda dostavbu schválila poměrem hlasů 11 : 8.

V té době prý také měl jako ministr průmyslu nečekaný telefonát od prezidenta Havla, který jej žádal, aby návrh stáhl a dostavbu Temelína zastavil. Stále opakoval, že jaderné elektrárny jsou neekologické a nebezpečné.