Týká se to rovněž způsobu jmenování profesorů. Pravomoc hlavy státu by měla být spíše formální. Prezident by neměl určovat, kdo profesuru získá. O tom se rozhoduje v poměrně složité proceduře, která je v kompetenci vysokých škol či univerzit a kterou upravuje zákon o vysokých školách.

Nad dodržováním pravidel dohlíží ministerstvo školství. Na konci celého procesu je potom jmenování profesorů prezidentem republiky.

Miloš Zeman to nechce u tří návrhů učinit. Podobně se už zachoval v případě Martina Putny. Tomu odmítl předat jmenovací dekret a nechal se zastoupit ministrem školství.