Podle zprávy Evropského účetního dvora z roku 2011 byl český vnitřní kontrolní systém dokonce nejhorší v celé EU. Právě kvůli jeho selhání měla Česká republika problémy s čerpáním evropských fondů a musela platit miliardové korekce. Nový zákon o vnitřním řízení a kontrole zjednodušuje současný nepřehledný systém, snižuje administrativní zátěž pro poskytovatele a zvyšuje jeho účinnost.

„Poskytovatelé byli v posledních letech zavaleni řadou kontrol, které velmi často kontrolovaly totéž bez jasných výsledků. Zejména pro obce to byla neúměrná zátěž. To se změní. Rušíme například nesystémovou veřejnosprávní kontrolu, ale posilujeme audit,” řekl první náměstek ministra financí Lukáš Wagenknecht.

Zásadní nedostatky v řízení a kontrole veřejných financí kritizuje i poslední výroční zpráva BIS. Za hlavní problémy veřejné správy označila mimo jiné i netransparentní rozhodovací procesy a nízkou odpovědnost úředníků. Nový zákon řeší tyto nedostatky. Konkrétně zákon jasně stanoví osoby, které budou za řízení a kontrolu hospodaření s veřejnými prostředky zodpovědné. Rozhodování a s tím spojenou odpovědnost bude možné delegovat, ale pouze o jednu úroveň níže.