Premiér Bohuslav Sobotka a ministerský předseda Horst Seehofer deklarovali další prohlubování intenzivní spolupráce České republiky s vládou Svobodného státu Bavorsko, kterou se podařilo v několika uplynulých letech navázat. Důvodem je mimo jiné fakt, že Bavorsko je velmi důležitým regionem z hlediska českého zahraničního obchodu. Třetina českého exportu (32 %) směřuje do SRN a téměř třetina (29,2 %) z této třetiny míří právě do Bavorska.

Jednou z hlavních priorit česko-bavorské spolupráce je oblast vědy, výzkumu a inovací. Bavorsko patří k nejúspěšnějším evropským regionům v oblasti vyspělých technologií a aplikovaného výzkumu. České firmy a výzkumné instituce tak získají velký prostor pro spolupráci na inovativních projektech.