Výluka se dotkne i provozu speciálních letních vlaků „Český ráj“. Spoje Sp 1531 a Sp 1532 Český ráj budou během výluky vedeny odklonem mimo stanice Praha-Libeň a Nymburk město. Po odklonové trase pojedou také rychlíky linky R10 Praha – Hradec Králové – Trutnov, které budou během výluky zastavovat místo stanice Praha-Libeň ve stanici Praha-Vysočany.

Náhradní doprava je organizována podle výlukového jízdního řádu, který najdou cestující na webu Českých drah ZDE, v aplikaci Můj vlak a na vývěskách v dotčených stanicích. Náhradní autobusová doprava bude zajištěna nízkopodlažní vozidly. Z kapacitních důvodů nebude v autobusech možná přeprava jízdních kol.

Umístění zastávek náhradní autobusové dopravy: