Obchod se zeměmi EU pokrývá v současnosti téměř 84 % celkového vývozu a 67 % celkového dovozu, což představuje oproti roku 2000 pokles o téměř 3 procentní body na vývozu a 8 na dovozu. „Naším nejvýznamnějším partnerem při vývozu i dovozu zboží je dlouhodobě Německo, kam v posledním roce směřovala třetina všech vývozů a dovezla se odtud cca čtvrtina veškerého českého importu,“ upozorňuje Václav Rybáček, ředitel sekce makroekonomických statistik ČSÚ. Přebytek zahraničního obchodu s Německem dosáhl v roce 2018 hodnoty 212,4 mld. Kč, oproti 53 mld. Kč v roce 2000.

Dlouhodobě záporná je obchodní bilance se státy mimo EU, a to i vzhledem k závislosti na nákupu surovin, zejména ropy a zemního plynu. Růst bilance přebytků se zeměmi EU28 (692,2 mld. Kč v roce 2018, oproti 244,7 mld. v roce 2004) nicméně převýšil rostoucí deficit se zeměmi mimo EU (-549,8 mld. Kč v roce 2018, oproti -270,0 mld. v roce 2004). Na celkové saldo zahraničního obchodu tak měl pád obchodních bariér se zeměmi EU po vstupu České republiky do Unie v roce 2004 pozitivní vliv.