Povodně ze srpna 2002 překonaly tehdejší protipovodňová opatření pražského metra, která byla připravena na tzv. stoletou vodu. Hladina řeky Vltavy však byla ještě o 150 cm vyšší. Na základě této zkušenosti DPP učinil taková protipovodňová opatření, která zabrání opakování ničivého scénáře. Mezi nejdůležitější patří navýšení ochranných zdí stanic či zamezení pronikání vody do metra skrze kanalizaci.