Může tak konečně začít dlouho očekávaná záchrana této jedinečné národní kulturní památky. Rekonstrukce by měla trvat tři a půl roku do října 2018 – skončí tedy v roce dvousetletého výročí založení instituce. V centru Prahu tak vznikne velký muzejní komplex propojením novorenesanční Historické budovy s Novou budovou Národního muzea.

Stávající muzejní budova je provozně i technologicky nevhodná, je ve špatném technickém stavu - v roce 2011 ji Hasičský záchranný sbor doporučil pro návštěvníky uzavřít.