NEN má řadu výhod, které oceňují jak starostové obcí coby zadavatelé, tak dodavatelé, ale i stát. Zadavatel v něm získává nástroj, jenž mu umožní plně elektronickou komunikaci s dodavateli v maximálním možném rozsahu, je zcela zdarma a uchovává a archivuje jeho data ze zadávání veřejných zakázek v rukou státu respektive MMR. Dodavatel pak získává nástroj, který mu umožní komunikovat se zadavatelem plně elektronicky, informuje ho o nových obchodních příležitostech, navíc mu zajistí online přehled nad aktivitou zadavatele ve vybraných zakázkách, přičemž všechny výše uvedené výhody jsou zcela zdarma.

Stát díky NEN dokáže získat pod kontrolu proces elektronického zadávání veřejných zakázek z pohledu plnění povinnosti elektronické komunikace vycházející ze směrnice EU, finanční náročnosti na zajištění povinné elektronizace a dat vzešlých z veřejných zakázek (data jsou ve vlastnictví státu, nikoliv soukromých firem).