Projekty jsou standardně zaměřeny do jednoho ze čtyř specifických cílů: Udržitelná doprava, Bezpečná a odolná doprava a dopravní infrastruktura, Přístupná a interoperabilní doprava a Automatizace, digitalizace, navigační a družicové systémy. Hlavní cíl programu, a tím i projektů v programu podporovaných, je pak rozvíjet dopravní sektor způsobem, který bude reflektovat společenské potřeby, akceleruje technologický a znalostní rozvoj ČR a napomůže růstu konkurenceschopnosti ČR.

V rámci reakce na situaci kolem COVID-19 bylo nad rámec standardního zaměření projektů zdůrazněno také téma zvládání mimořádných situací. Řešení a výsledky těchto návrhů projektů by měly přispět ke zmírnění negativních dopadů těchto mimořádných událostí na dopravu a hospodářství.