Kontrola začala v průběhu účetního období 2022. SÚJB tak mohl průběžně opravit významné nedostatky, které kontroloři zjistili a které by měly ve výši 53,6 milionu korun vliv na zůstatky položek účetní závěrky SÚJB za rok 2022. SÚJB kromě toho provedl i četné změny systémového nastavení vedení účetnictví a výkaznictví: např. až na základě upozornění NKÚ začal sestavovat účetní výkazy přehled o peněžních tocích a přehled o změnách vlastního kapitálu jakožto povinné součásti účetní závěrky.

Po provedených opravách bylo účetnictví SÚJB podle názoru NKÚ vedeno v souladu s právními předpisy. Nesprávnosti ve výši 1,4 milionu korun, které SÚJB neopravil, neměly významný dopad na účetní závěrku, která dle NKÚ podává věrný a poctivý obraz předmětu účetnictví.