Námitky ÚOHS přitom nesměřují proti vzniku nového úřadu jako takového: ÚOHS upozorňuje, že kompetence, které se týkají ochrany hospodářské soutěže a které musejí být vykonávány zcela nezávislým úřadem, by mohl efektivněji provádět on sám; naopak další úkoly, které má podle návrhu Ministerstva dopravy nový úřad plnit, nevyžadují existenci po všech stránkách nezávislé instituce, a nákladné zřizování nového, specializovaného úřadu proto ÚOHS nepokládá za efektivní.