Šéf NKÚ si soudu stěžoval na postup Poslanecké sněmovny a jejího kontrolního výboru. Domáhal se například toho, aby mu sněmovna a výbor přestaly ukládat pokuty a hrozit mu dalšími postihy, pokud nesplní jejich příkazy. Požadoval se také zrušení padesátitisícové pokuty, kterou mu letos v únoru uložil sněmovní kontrolní výbor. Ústavní soud ale Dohnalův podnět odmítl bez veřejného jednání.

Dohnal je v poslední době pod stálým tlakem poslanců. Pokutu 50 tisíc korun mu uložil kontrolní výbor podle zákona o státní kontrole z roku 1991, neboť prý neumožnil kontrolu sněmovny na svém úřadu. Poslanci chtěli kontrolou zjistit, zda se obvinění kolegia úřadu na údajné plýtvání penězi zakládá na pravdě.