V první z kontrol prověří úřad peníze poskytnuté na podporu podnikatelských nemovitostí a infrastruktury. Půjde například o poskytování a vyhodnocení podpory pro průmyslové zóny, případně na regeneraci území a objektů určených pro následné průmyslové a podnikatelské využití. Kontroloři zamíří na Ministerstvo průmyslu a obchodu, do agentury CzechInvest a do Agentury pro podnikání a inovace.

V druhé kontrole prověří úřad nemovitý majetek armády a peníze s ním související. Jde o jednu ze tří letošních kontrol zaměřených na obranu, kromě této bude úřad prověřovat peníze na vzdušné síly a armádní výstroj. Hospodařením s armádními nemovitostmi se zabýval úřad již v kontrole z roku 2014, kdy se ale zaměřil na nákup služeb stravování, správy nemovitostí a střežení objektů. Zjistil tehdy mimo jiné, že Ministerstvo obrany zadávalo zakázky na technickou ostrahu muničních skladů účelově jednomu dodavateli v jednacím řízení bez uveřejnění, přestože podle NKÚ měla být vypsána otevřená soutěž.