Kontrolní výbor Sněmovny uložil Dohnalovi v roce 2010 pokutu kvůli tomu, že výboru odmítl vydat podklady umožňující audit hospodaření NKÚ. Dohnal se proti tomuto rozhodnutí odvolal, odvolání však sněmovna zamítla, a tehdejší prezident NKÚ se proto obrátil na soud. Ten mu loni v listopadu vyhověl, rozhodnutí o odvolání zrušil a věc poslancům vrátil k novému projednání. Sněmovna však podle Dohnala nestihla rozhodnout v zákonné třicetidenní lhůtě, a proto na ni podal žalobu, kterou se domáhá rozhodnutí poslanců do 14 dnů od právní moci rozsudku.

Odsouzený Dohnal musel opustit NKÚ

Za opakovanou neochotu vydat materiály byl Dohnal potrestán i soudy, a to osmiměsíčním trestem vězení podmíněně odloženým na zkušební dobu 18 měsíců. Kvůli pravomocnému verdiktu musel odejít z čela úřadu. Tím, že s poslanci odmítl spolupracovat, poškodil podle soudů právo ČR na kontrolu hospodaření s majetkem státu, a zneužil tak pravomoc úřední osoby.