Jako první německý prezident navštívil obec Lidice, která byla nacisty vypálena 10.6. 1942 jako odplata po úspěšném provedení atentátu na zastupujícího říšského protektora R. Heydricha. Poklonil se zde památce 173 zastřelených lidických můžů a hovořil s přeživšími této tragédie. Gauckova návštěva Lidic je dalším významným posunem v česko - německých vztazích, jejichž další etapu symbolicky uzavírá a zahajuje kvalitativně novou.

J. Gauck, jenž nastoupil do úřadu v březnu 2012, tak učinil již druhý výrazný krok směrem k úplnému historickému vyrovnání mezi oběma zeměmi. Nejdříve v červnu 2012 zaslal svému českému protějšku omluvný dopis, v němž se omlouvá ze nacistická zvěrstva učiněná za druhé světové války na českém národu. Napsal prezidentovi Klausovi, že Němci si jsou vědomi činů , kterých se dopustili a že se za ně stydí.