Z důvodu stárnoucí populace v zemědělství a odchodu pracovních sil do jiných odvětví je nedostatek kvalifikovaných pracovníků. Chybí agronomové a zootechnici, kteří se podílejí na přípravě dotací, bez nich by těžko vznikl osevní plán či welfare. U malých zemědělců je problém podat i Jednotnou žádost na plochu, protože neumí na počítači či nemají ani internet. Tito zemědělci nemají kolikrát ani nástupce ani pomocnou sílu.

Snižuje se živočišná produkce např. z důvodu rušení mlékáren či malá podpora ze strany EU, která více podporuje rostlinnou výrobu. Lze to vidět u podpory národních dotací v roce 2024 na živočišnou výrobu, kde nastaly razantní vratky pro zemědělce, když dostali vysoké zálohy a na konci roku MZe nemělo peníze na doplacení. U některých případů byly vratky na místě, když si v předžádosti navýšili počet kusů zvířat, než ten rok měli na hospodářství.